15-летнее руководство Ендовицкого университетом, начавшееся в 2009 году и продолжавшееся до июня 2024 года, неожиданно завершилось обвинениями в тяжких преступлениях.
После отстранения Ендовицкого исполняющей обязанности ректора ВГУ назначена Елена Чупандина, ранее занимавшая пост первого проректора по учебной работе и декана фармацевтического факультета. Обладая значительным опытом работы в университете и высоким научным званием профессора, доктора фармацевтических наук, Елена Чупандина, с момента своего назначения в качестве временно исполняющего обязанности ректора с 11 марта, взяла на себя ответственность за управление одним из ведущих вузов Воронежской области.
Арест Дмитрия Ендовицкого произошёл в июне 2024 года. Его обвинили в даче взятки в особо крупном размере, что квалифицируется по части 4 статьи 291 УК РФ и карается лишением свободы на срок до 12 лет. Ситуация усугубилась дополнительным обвинением в незаконном распространении порнографических материалов в интернете (п. «б» ч. 3 ст. 242 УК РФ), за что грозит до шести лет лишения свободы. Масштабы обвинения поражают: следствие собрало 15 томов материалов дела, включающих более 300 видеофайлов.
В деле фигурирует не только бывший ректор. Вместе с Дмитрием Ендовицким проходит профессор ВГУ Юрий Трещевский, обвиняемый в посредничестве во взяточничестве в особо крупном размере (п. «б» ч. 3 ст. 291.1 УК РФ), что грозит ему до 10 лет заключения. По версии следствия, Ендовицкий, используя Трещевского в качестве посредника, передал в феврале 2022 года 600 тысяч рублей председателю диссертационного совета Воронежского государственного технического университета, Наталье Сироткиной, для обеспечения получения степени доктора наук его супругой, Еленой Ендовицкой. Оба обвиняемых, Ендовицкий и Трещевский, отрицают свою вину.
Дмитрий Ендовицкий содержится в следственном изоляторе, а Юрий Трещевский находится под домашним арестом. В конце февраля 2025 года им была продлена мера пресечения до 12 августа 2025 года.