По версии следствия, он нанес ущерб Министерству обороны России на сумму более 49 млн рублей. Обвинение просило для него 14 лет колонии.
Приговор оказался заочным. Вышегородцев в апреле 2022 года скрылся от суда и уехал за границу. Интерпол снял с арбитражного управляющего статус инициированного Генпрокуратурой РФ нахождения в международном розыске в начале ноября, так как посчитал, что у него есть вопросы к российским данным.